Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf1P46099 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf1P46099 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf1P46099 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms