Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pik3caP42337 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pik3caP42337 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pik3caP42337 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Pik3caP42337 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pik3caP42337 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pik3caP42337 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms