Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd1P40201 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd1P40201 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd1P40201 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd1P40201 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms