Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fen1P39749 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fen1P39749 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms