Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpargP37238 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpargP37238 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpargP37238 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpargP37238 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpargP37238 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PpargP37238 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpargP37238 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PpargP37238 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpargP37238 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms