Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Flt1P35969 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms