Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddit3P35639 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms