Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PpardP35396 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PpardP35396 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PpardP35396 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PpardP35396 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PpardP35396 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PpardP35396 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PpardP35396 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PpardP35396 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PpardP35396 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PpardP35396 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PpardP35396 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PpardP35396 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PpardP35396 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PpardP35396 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PpardP35396 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PpardP35396 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms