Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms