Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola1P33609 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola1P33609 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola1P33609 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola1P33609 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola1P33609 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pola1P33609 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms