Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SsbP32067 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SsbP32067 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SsbP32067 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SsbP32067 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SsbP32067 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SsbP32067 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SsbP32067 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SsbP32067 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SsbP32067 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SsbP32067 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SsbP32067 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SsbP32067 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SsbP32067 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SsbP32067 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SsbP32067 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SsbP32067 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SsbP32067 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms