Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa11P31311 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa11P31311 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms