Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc10P31257 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc10P31257 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms