Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp1P29452 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp1P29452 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms