Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pabpc1P29341 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms