Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprmP28828 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprmP28828 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprmP28828 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprmP28828 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprmP28828 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprmP28828 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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