Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxraP28700 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RxraP28700 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxraP28700 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RxraP28700 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxraP28700 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxraP28700 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RxraP28700 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms