Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col2a1P28481 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col2a1P28481 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms