Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd40lgP27548 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms