Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PdgfraP26618 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PdgfraP26618 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms