Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tln1P26039 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tln1P26039 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tln1P26039 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tln1P26039 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tln1P26039 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tln1P26039 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tln1P26039 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tln1P26039 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tln1P26039 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tln1P26039 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tln1P26039 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tln1P26039 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms