Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccnd1P25322 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms