Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria1P23818 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms