Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja1P23242 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms