Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PparaP23204 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PparaP23204 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PparaP23204 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PparaP23204 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PparaP23204 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PparaP23204 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PparaP23204 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PparaP23204 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PparaP23204 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PparaP23204 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms