Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pou3f1P21952 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou3f1P21952 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms