Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpcP21841 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpcP21841 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms