Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Myo5bP21271 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5bP21271 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms