Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim1P20664 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim1P20664 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim1P20664 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms