Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VimP20152 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VimP20152 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VimP20152 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
VimP20152 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VimP20152 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VimP20152 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VimP20152 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VimP20152 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VimP20152 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VimP20152 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms