Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NefhP19246 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NefhP19246 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NefhP19246 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NefhP19246 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NefhP19246 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NefhP19246 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NefhP19246 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NefhP19246 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NefhP19246 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NefhP19246 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NefhP19246 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms