Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifrd1P19182 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifrd1P19182 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms