Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc1P18828 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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