Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps6ka1P18653 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms