Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn1P18608 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms