Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18532 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18532 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18532 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18532 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18532 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18532 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18532 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18532 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18532 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18532 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18532 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18532 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18532 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms