Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P18530 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P18530 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P18530 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P18530 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18530 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18530 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P18530 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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