Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpraP18052 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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