Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcnaP17918 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcnaP17918 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcnaP17918 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms