Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa-rs1P17533 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms