Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou4f1P17208 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou4f1P17208 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms