Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra6P16305 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms