Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PrkceP16054 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkceP16054 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms