Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rag1P15919 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rag1P15919 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms