Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-D1P14427 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms