Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Il1r1P13504 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms