Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb2P13373 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms