Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms