Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Lcn2P11672 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn2P11672 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Lcn2P11672 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Lcn2P11672 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lcn2P11672 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms