Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms